Chromas

ChromasProの使い方を教えて下さい

Answer

1. はじめに

ChromasProは、複数のDNA配列決定プロジェクトを管理するための実用的なツールです。数メガベースまでのDNA配列アセンブリプロジェクトや、基本的な配列編集・解析に適しています。

2. 配列の開き方

ChromasProは、Applied Biosystems .ab、Staden Chromatogram(SCFとZTR)、454 SFF、FASTA、FASTQ、EMBL、GenBank、SwissProt、GenPept、GCG RSF、プレーンテキストなど、様々な形式の配列を開くことができます。

3. 配列の保存

.ab1、.scf、.fasta、.fastq形式で配列を保存できます。

4. 配列のアセンブリ

ChromasProでは、グラフィカルインターフェースを使用して重複する配列をアセンブルできます。コンセンサス配列を生成し、編集のためにあいまいな部分をハイライト表示することができます。品質データを使用して低品質の配列を自動的に除去し、配列アセンブリの品質を向上させます。

5. 参照配列の使用

アセンブリのスキャフォールドとして参照配列を使用できます。

6. マップの生成

ChromasProは制限酵素サイトとフラグメントマップを生成し、切断酵素、非切断酵素、フラグメントをリストアップできます。

7. オープンリーディングフレーム(ORF)

G+Cフレームプロットを利用してオープンリーディングフレームをマッピングし、ワンクリックでORFを翻訳できます。

8. 印刷

クロマトグラム、制限酵素サイトとフラグメントマップ、オープンリーディングフレームマップを印刷できます。

9. 検索の実行

NCBIウェブサイトを通じて核酸およびタンパク質のBLAST検索を行うことができます。完全一致または最適アライメントによる配列検索が可能です。

10. 多重アライメント

ClustalWとのインターフェースを介して多重アライメントを実行できます。

11. 配列の編集

配列とクロマトグラムの反転と相補鎖の生成ができます。核酸配列の編集時に翻訳を表示できます。

12. タンパク質解析

逆翻訳の実行と核酸の縮重度のプロットができます。また、タンパク質の親水性と抗原性をプロットすることもできます。

13. 画像のコピー

クロマトグラムの一部の画像をコピーして、ドキュメントやプレゼンテーションに貼り付けることができます。

14. 互換性

ChromasProはWindows 7sp1、8、10、11と互換性があります。

15. 無料試用版とライセンス

無料試用期間は14日間です。ライセンスについては購入ページをご覧ください。

商品の詳細とお問い合わせはこちらから↓↓
 ChromasPro製品ページ

-Chromas