DNA Sequence Assemblerは、DNA配列の組み立てや解析に役立つバイオインフォマティクスソフトウェアです。DNA配列の組み立てとは、断片的なDNA配列を連結して完全なゲノムを再構築することです。このプロセスには、NGS（次世代シーケンシング）やTGS（第三世代シーケンシング）という技術が利用されます。これらは生物学的なビッグデータを生成し、配列組み立てに対する関心を高めています。
DNA Sequence Assemblerは、このプロセスを完全に自動化し、高速で正確な結果を提供します。サンプルがあるフォルダを指定するだけで、プログラムがすべてのステップを自動的に行ってくれます。プログラムは、オーバーラップする部分を見つけて配列をアラインメントし、コンティグと呼ばれる長い連続した配列にまとめます。コンティグの数や長さは、入力された配列の質や量によって異なります。
DNA Sequence Assemblerでは、配列の編集や突然変異の検出などの機能も備えています。編集機能では、クロマトグラム（塩基ごとの信号強度）を表示したり、不要な部分を削除したり、ミスマッチや挿入・欠失などのエラーを修正したりできます。突然変異検出機能では、参照配列と比較して変化した箇所を特定したり、SNP（一塩基多型）やインデル（挿入・欠失）などのタイプを識別したりできます。
さらに、DNA Sequence Assemblerでは、異なるファイル形式間で配列を変換することもできます。例えば、ABIからFASTAやSCFからTXTなどに変換できます。これにより、他のソフトウェアやデータベースと互換性が高まります。
価格も手頃で使いやすいインターフェイスが特徴です。
【ライセンスについて】
Business版、Academic版がございます。
永久ライセンス/年間ライセンスからお選びください。
Moduleは下記からお選びいただけます。
Basic tools
Standard sequence assembly
Batch sequence assembly
Mutation detection
Base caller
Batch sequence processing & conversion
Sequence assembly scripting
詳細についてはお問い合わせください。
試用版ダウンロードはこちら
メーカーの製品サイト
http://www.dnabaser.com/
【種別】シェアウェア
【言語】英語
DNA Sequence Assemblerは、このプロセスを完全に自動化し、高速で正確な結果を提供します。サンプルがあるフォルダを指定するだけで、プログラムがすべてのステップを自動的に行ってくれます。プログラムは、オーバーラップする部分を見つけて配列をアラインメントし、コンティグと呼ばれる長い連続した配列にまとめます。コンティグの数や長さは、入力された配列の質や量によって異なります。
DNA Sequence Assemblerでは、配列の編集や突然変異の検出などの機能も備えています。編集機能では、クロマトグラム（塩基ごとの信号強度）を表示したり、不要な部分を削除したり、ミスマッチや挿入・欠失などのエラーを修正したりできます。突然変異検出機能では、参照配列と比較して変化した箇所を特定したり、SNP（一塩基多型）やインデル（挿入・欠失）などのタイプを識別したりできます。
さらに、DNA Sequence Assemblerでは、異なるファイル形式間で配列を変換することもできます。例えば、ABIからFASTAやSCFからTXTなどに変換できます。これにより、他のソフトウェアやデータベースと互換性が高まります。
価格も手頃で使いやすいインターフェイスが特徴です。
【ライセンスについて】
Business版、Academic版がございます。
永久ライセンス/年間ライセンスからお選びください。
Moduleは下記からお選びいただけます。
Basic tools
Standard sequence assembly
Batch sequence assembly
Mutation detection
Base caller
Batch sequence processing & conversion
Sequence assembly scripting
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http://www.dnabaser.com/
【種別】シェアウェア
【言語】英語
